دفتر امور پژوهشي انستيتو در زمينه امور كارشناسي علمي و متدولوژي، آماري، اداري و مالي و انتشار گزارش پروژه‌هاي پژوهشي بمنظور توسعه پژوهش با به كارگيري متد و روشهاي اصولي تحقيق، امكان ارتقاء اعضاء هيأت علمي پژوهشي و محققين به استناد ضوابط موجود و گسترش انتشار مقالات علمي در مجلات داخلي و خارجي فعاليت مي‌نمايد. مدير پژوهشي كنوني انستيتو سركار خانم دكتر عصمت ناصري مي‌باشند.

ارتقاء كمي و كيفي طرحهاي پژوهشي و ارتقاء آگاهي پژوهشگران و اعضاي هيئت علمي

1- ارائه پيشنهاد و پروژه‌هاي پژوهشي به منظور توسعه امور پژوهشي انستيتو

2- مطالعه و بررسي آيين نامه ها و دستورالعملهاي پژوهشي انستيتو و پيشنهاد اصلاحات مورد نياز بر اساس شرايط موجود و آينده انستيتو

3- مشاوره براي انجام امور طراحي پروژه‌هاي پيشنهادي بر اساس الگوي تعيين شده، تنظيم گزارشات پيشرفت و نهايي و مقالات، تعيين حجم نمونه، استخراج و آناليز آماري طرحها و پايان نامه‌هاي تحقيقاتي

4- پيش بيني اعتبار لازم براي اجراي طرحها و فعاليتهاي پژوهشي

5- هماهنگي و انجام امور مربوط به تشكيل جلسات شوراي پژوهشي و ساير شوراها و کميته ها

6- مكاتبات مربوط به صورتجلسات شوراي پژوهشي، تصويب طرحها، تنظيم قراردادها، بودجه‌بندي و پيگيري نحوه پرداختها، دريافت اسناد هزينه و تسويه مالي طرحهاي تحقيقاتي

7- ادامه و ترويج نتايج فعاليتهاي پژوهشي انستيتو در اجتماع از طريق وسايل ارتباط جمعي، تهيه كتاب و جزوات مربوط به پروژه‌هاي تحقيقاتي و عملكرد پژوهشي اين مؤسسه و ارائه آن به مراكز علمي و تحقيقاتي كشور

8- تهيه آمار و اطلاعات لازم در خصوص مسائل پژوهشي جهت ارائه به شوراي عالي

9- نگهداري و به روز رساني سيستم‌ها و بانكهاي اطلاعاتي مورد استفاده در انستيتو

10- ارائه پيشنهاديه هاي پژوهشي به شوراي پژوهشي و پيگيري فرآيند تصويب، مديريت و نظارت اجراي پروژه‌ها و به تصويب رساندن گزارش هاي نهايي

11- انجام فرآيند بررسي و داوري پروژه‌هاي پژوهشي و پيگيري امور مالي و اجرايي مربوطه

12- انجام امور کارشناسي مربوط به مقدار بودجه لازم براي انجام فعاليت هاي پژوهشي و نظارت بر هزينه کرد آنها

13- فراهم آوردن امکانات براي آناليز داده هاي پروژه‌هاي پژوهشي

14- برگزاري کارگاه ها، سمينارها، کنگره هاو جشنواره ها در زمينه علوم تغذيه و صنايع غذايي و همکاري با ديگر سازمان ها در اين زمينه