بخش فوق تخصصي جراحي قلب و عروق اين مركز بيش از 30 سال قدمت دارد و مشتمل است بر 4 اتاق عمل فعال، ICU جراحي قلب بزرگسال با تعداد 12 تخت،  ICU جراحي قلب اطفال با تعداد 6 تخت و بخش هاي قبل و بعد از عمل با تعداد حدود 30 تخت مي باشد.
تعداد اعضاي هياٌت علمي اين بخش 9 نفر بوده و سالانه حدود 2تا 3 دستيار فوق تخصص جراحي قلب در اين بخش پذيرش شده و مورد آموزش قرار ميگيرند.

اعضاي هيأت علمي اين بخش عبارتند از:

دكتر مهران شاه زماني: فوق تخصص جراحي قلب و عروق، استاديار (رئيس بخش)
دكتر محمود بهشتي منفرد: فوق تخصص جراحي قلب و عروق، استاديار (مدير گروه جراحي قلب و عروق)
دكتر سيد احمد حسنتاش : فوق تخصص جراحي قلب و عروق، استاد
دكتر علي اصغر بلوريان : فوق تخصص جراحي قلب و عروق، دانشيار
دكتر مهنوش فروغي : فوق تخصص جراحي قلب و عروق، استاديار (معاون آموزشي بخش)
دكتر محمد كاظم عرب نيا : فوق تخصص جراحي قلب و عروق، استاديار
دكتر منوچهر حكمت : فوق تخصص جراحي قلب و عروق، استاديار
دكتر محمد مسعود مجيدي تهراني : فوق تخصص جراحي قلب عروق،استاديار                                                
دكتر علي محمد حلاج زاده: فوق تخصص جراحي قلب و عروق، استاديار

ميـزان فعالـيت هاي اين بخش حدود1400عمل جراحـي قلب باز و بسته در سـال بوده که نتـايج آن با استـانداردهـاي بيـن - المللي قابل مقايسه است.اين بخش از معدود بخش هاي جراحي قلب کشور است که مطالعه اکوکارديوگرافيک حين عمل براي بررسي دقيق بيماريها قبل از جراحي و نيز ارزيابي نتيجه عمل جراحي به صورت روتين انجام مي شود و نيز انجام اعمال جراحي مادرزادي پيچيده و جراحي کرونري بدون پمپ از فعاليت هاي برجسته اين بخش محسوب ميگردد.در حال حاضر 2 اتاق عمل جديد به مجموعه اتاق هاي عمل قلب افزوده شده که در آينده نزديک يکي از آنها بصورت اتاق عمل دو منظوره ( HYBRID ROOM ) جهت اعمال جراحي ENDO ( اندوواسکولر ) مجهز خواهد گرديد.
در امتحانات بورد فوق تخصصي رزيدنتها ي اين مرکز در اکثر سالها موفق به کسب رتبه کشوري شده اند.
درسال تحصيلي 89-88  حدود پنج طرح تحقيقاتي در اين بخش در حال اجرا است.

• برنامه آموزشي بخش جراحي قلب :
  
  - راند بخش هر روز از ساعت 45-6 الي 30-7
  - روزهاي يکشنبه هر هفته کلاس درس دکتر مير حسيني به زبان انگليسي
  - روزهاي دوشنبه هرهفته از ساعت 30/7 الي 30/8 کلاس مشترک با بخش بيهوشي به زبان انگليسي
  - روزهاي سه شنبه هرهفته ژورنال کلاب و کنفرانس کارديولوژي
  - آخرين پنجشنبه هر ماه از ساعت 30/10 الي 30/11 کنفرانس مورتاليتي موربيديتي
  - روزهاي شنبه و چهار شنبه ها کلاس درس ويژه رزيدنتها از ساعت 30/7 الي 15/8
  - درمانگاه صبح : ( روزهاي شنبه ، يک شنبه ، دوشنبه ، سه شنبه ، چهار شنبه )
  - درمانگاه عصر ( روزهاي شنبه ، يک شنبه ، دوشنبه ، سه شنبه )