اهداف کلان:
  تربیت نیروی انسانی کارآمد، دانش مدار و توانمند مبتنی بر نیازهای جامعه
  ارتقای سطح علمی، توانمندیها و ظرفیت سازی اعضای هیات علمی
  اعمال حاکمیت آموزشی
  ایجاد و ارتقای کیفی برنامه های آموزشی
  توسعه اصلاحات نظام آموزش در رشته های علوم پزشکی
  ارتقای جایگاه دانشگاه در سطح ملی، منطقه ای و جهانی
  توسعه عرصه جغرافیایی خدمات آموزشی در سطح داخل و خارج از کشور

ارزشها و اصول کلی:
  محوریت ارزشهای اسلامی و ملی
  استقرار عدالت در تمامی ابعاد
  حفظ کرامت انسانی 
  شایسته گزینی، شایسته مداری و شایسته سالاری
  دانایی محوری و ارزش مداری دانایی
  قانونمداری
  رضایت محوری
  بهره وری محوری
  نیازمحوری
  مشتری مداری

قلمرو:
در سطح کشور:
  در سطح کل کشور برنامه های مشترک بین رشته ای با همکاری دانشگاههای مرتبط در وزارت بهداشت و درمان و آموزش پزشکی و وزارت علوم، تحقیقات و فناوری
  ایجاد پایگاههای مشترک یا مستقل در مناطق آموزشی مختلف

در سطح منطقه:
  در سطح منطقه (شرق مدیترانه بویژه کشورهای اسلامی) تبادل اطلاعات علمی، استاد و دانشجو و همکاری مشترک اجرای برنامه های آموزشی منجر به گواهینامه معتبر یا مدرک دانشگاهی 
راه اندازی واحدهای آموزشی

در سطح جهانی:
  در سطح جهانی تبادل اطلاعات علمی، استاد و دانشجو و همکاری مشترک اجرای برنامه های آموزشی منجر به گواهینامه معتبر یا مدرک دانشگاهی
 
مشتریان:
  مردم و جامعه
  دانشگاهها و مراکز تحقیقاتی 
  وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی  
  صنعت
  جامعه، انجمن ها و سازمانهای مرتبط با گروه پزشکی داخل و خارج از کشور
  نهادهای دولتی، غیر دولتی و مردمی 
  متقاضیان ورود به دانشگاه در مقاطع مختلف تحصیلی
  دانشجویان ایرانی ممتاز خارج از کشور
  سازمان جهانی بهداشت
  مراکز ارائه خدمات بهداشتی درمانی
  مدیران عالی و اجرایی کشور
  متقاضیان روابط بین دانشگاهی

کانون توجه و تمرکز دانشگاه در حوزه آموزش:
یکی از کانونهای اصلی توجه دانشگاه به ارتقای کیفیت آموزش و کسب اعتبار ملی و جهانی می باشد که در این رهگذر بتواند در تربیت نیروی انسانی مورد نیاز کشور بطور موثرتری عمل نماید.
موضوع دیگری که بعنوان یک نکته قوت محسوب میشود و با تمرکز در آن می خواهد کارکرد مطلوبتری در توسعه سلامت و پزشکی جامعه بردارد، توجه به استعدادهای درخشان و نخبه پروری است که علاوه بر تامین بدنه کارشناسی قوی و مطمئن در حیطه سلامت و پزشکی بتواند سیستم های خبره را بوجود آورد.
کانون توجه دیگر دانشگاه در مجموعه مدیریت کلان دانشگاه، تمرکز بر توسعه رشته های تخصصی در مقطع تحصیلات تکمیلی است که تامین کننده بدنه تخصصی در عرصه سلامت و پزشکی و هیات علمی دانشگاه های علوم پزشکی و سایر دانشگاهها و موسسات تحقیقاتی مرتبط می باشد.
موضوع آخر در کانون توجه دانشگاه حفظ دست آوردهای ارزشمند خود در زمینه اصلاح آموزش پزشکی و گسترش آن از رشته پزشکی عمومی به سایر رشته ها است.

ویژگیهای ممتاز دانشگاه:
پیشرو بودن در عرصه آموزش پزشکی و مدیریت آن و ایفای نقش رهبری در سطح کشور می باشد که بعنوان یکی از ویژگیهای ممتاز در سطح کشور می باشد
شکل گیری برنامه تمایز یافته استعدادهای درخشان که عملا نقش هدایت و رهبری آن را در سطح کشور هم برعهده گرفته است یکی از نقاط شاخص  ممیز دانشگاه می باشد که به بهره گیری از این وجه ممیزه می تواند کارکرد کاملا بارز و آشکار در سطح کشور داشته باشد.
یکی از نقطه تمایزات دانشگاه وجود بسترهای لازم برای بهره گیری سازمان یافته از فناوری اطلاعات و ارتباطات در عرصه آموزش علوم پزشکی درسطح دانشگاههای وابسته به وزارت بهداشت و درمان و آموزش پزشکی می باشد. راه اندازی مرکز آموزش از راه دور و تشکیل هسته کاری آموزش مبتنی بر شبکه و با بهره گیری از امکانات فناوری اطلاعات در سال 86 تحول عمده ای را در سطح کشور و در عرصه آموزش گروه پزشکی بوجود خواهد آورد.
از نقاط ممیز دیگر دانشگاه می توان قرار گرفتن در بین سه رتبه اول رتبه بندی دانشگاه های علوم پزشکی کشور می باشد . در این رابطه با توجه به وجود توانمندیهای بالقوه و بالفعل، دانشگاه توانمندی ارتقای وضعیت خود را در رتبه بندی دانشگاه ها دارد