دانشکده دارای شش گروه آموزشی می باشد شامل:
1. گروه شیمی داروئی
2. گروه فارماسیوتیکس
3. گروه سم شناسی و داروشناسی
4. گروه فارماکوگنوزی و بیو تکنولوژی دارویی
5. گروه داروسازی بالینی
6. گروه اقتصاد و مدیریت دارو